商标数字证书是由国家工商总局政务外网身份认证中心负责审核、发放的，为保证使用网上申请系统在互连互通的信息交换时能正确标识实体身份的用户身份认证证明。数字证书持有人应当妥善保管数字证书载体。用户线上申请商标数字证书的流程大概如下：
在线填写申请表
1、登录中国商标网，点击“网上申请”，进入“商标网上申请系统”。点击“商标网上申请指南”，再点击“商标数字证书申请指南”，然后再点击“商标数字证书申请流程”，仔细阅读该文档。点击文档后的“商标数字证书申请表”，按页面提示如实填写，检查无误后提交申请表。
2、提交成功后，系统将自动随机产生激活码，证书申请人务必牢记并切勿外泄激活码。首次登录本系统提交商标网上申请时，须使用激活码激活数字证书。
3、下载pdf格式的《商标数字证书业务办理表》、《工商总局数字证书申请责任书》。《商标数字证书业务办理表》是根据申请人所填写的信息生成的，申请人应立即下载该《商标数字证书业务办理表》，同时还应下载《工商总局数字证书申请责任书》。
准备数字证书
(一)每份申请材料包括以下书件：
1、《商标数字证书业务办理表》
2、工商总局数字证书申请责任书
3、营业执照(或主体资格证明文件)复印件
4、持证人(保管数字证书载体的人)的身份证复印件。
注意：1、第1至第2的书件均是在步骤一下载后打印的。
2、上述材料都应加盖数字证书申请人(商标代理组织)公章。
(二)数字证书申请材料的填写要求：
1、商标数字证书业务办理表(注：此处系申请表)内容必须与数字证书申请人在网上申请系统填写的数字证书电子申请表的内容完全一致(注意：下载pdf格式的商标数字证书业务办理表后，应正反面打印)。
2、所有书件都用a4纸打印或复印。
3、数字证书申请人应如实填写。否则，承担相应后果。
4、申请材料都应签章。
证书领取方式
“商标数字证书”制作完成后，将在商标网上申请系统刊登数字证书领取通知，数字证书申请人应当到商标局直接领取“商标数字证书”。直接领取数字证书，应当持介绍信、营业执照复印件、经办人身份证复印件到商标局计算机处领取；领取时，应当出示经办人身份证(原件)。前述介绍信、营业执照复印件、经办人身份证复印件都应当加盖商标数字证书申请人公章。
收到“商标数字证书”后，务必牢记“证书唯一信任号”，因为办理数字证书后续业务需要该号。