曾因境内建立皇家粮仓，故名太仓。又因古代地属娄县，并在娄县东境，别称娄东。又因地处古代海岸线——冈身之上，又称冈身。
太仓滨海枕江，《书经·禹贡》中说，属扬州之域。春秋时属吴地，吴王尝于其地置仓。越灭吴，楚败越，尽取吴故地，迁封春申君黄歇于吴。春申君置东西两仓，（太仓）地属东仓。志乘证实，太仓的得名，最早可溯至春秋时代。北宋时，邑人郏亶《吴中水利书》言：“昆山之东，地名太仓，俗号冈身……”由此可见，北宋时，太仓就作为正式地名存在了。
太仓又称娄东，公元前221年秦始皇统一中国后，废除了周代的“分封制”，实行“郡县制”，把天下分为36郡，今太仓地区属于会稽郡（治所在今苏州市区）娄县。娄县地域范围包括今天的昆山、太仓、嘉定、上海等地，其县治在距今昆山老城区东北三里许地方，太仓位于它的东面，所以被称为“娄东”，这是指太仓之地在“娄县”之东。
公元前221年秦始皇统一中国后，废除了周代的“分封制”，实行“郡县制”，把天下分为36郡，今太仓地区属于会稽郡（治所在今苏州市区）娄县。太仓位于它的东面，所以被称为“娄东”又因经过娄门，流向今昆山、太仓，最终汇入长江、东海的那条大河称为“娄江”。太在的“娄“娄江”之东，因此别名娄东。太仓原属,嘉定、昆山、常熟。明弘治十年（1497年）割嘉定（乐智、循义2乡）、昆山（新安、惠安、湖川3乡）常熟（双凤乡）3县之地置太仓州。清雍正三年（1725年），总督查弼纳以苏州、松江、常州三府赋重事繁，奏请升州增县，以分其任，遂升太仓为直隶州，分置镇洋县，同城而治，领镇洋、崇明、嘉定、宝山四县，为苏松常太道的组成部分。民国元年（1912年），太仓州和镇洋县合并，定名太仓县，至民国16年属沪海道。民国二十四年属无锡督察区。民国二十六年，日本侵略军占领太仓。民国三十年，中国共产党在鹿河地区建立抗日民主政府——太仓县政府，下辖3个区。1949年5月13日太仓解放，太仓县人民政府成立。先后属苏州专区、地区，1983年划归苏州市。1993年3月经国务院批准撤县设县级太仓市，由苏州市代管。
2013年末，太仓下辖城厢镇、浏河镇、浮桥镇、沙溪镇、璜泾镇、双凤镇、港口开发区、经济开发区、科教新城 [21] ，有娄东街道办和88个建制村（行政村）、3205个村民小组、67个居民委员会。