最近两年，大部分省份都将二本和三本合并了，也就是说大部分省份已经没有本科三批录取了，但实际上，无论二本三本合并与否，之前的“三本”仍然是潜在的，独立院校的性质没有改变。“三本”一般是指独立学院，大多为“公办民助”或者“纯民办”，具有“校园独立、招生独立、财务独立”的特点，但校名一般都是“某某大学某某学院”。
很多加长同学认为考上了独立学院就和上了本部大学是一样的，只是花更多的钱而已，实际上并不是，独立学院和一本二本本部大学仍然存在很大的区别，主要体现在：
一、学校名称不一样
一本二本大学的学校名称一般为“某某大学”或“某某学院”，比如北京大学、清华大学、南昌大学等，而独立学院的学校名称一般是“某某大学某某学院”，如最近网络上很火的同济大学浙江学院。
二、学校本质上的不同
一本二本大多数是公办大学，独立院校一般为“公办民助”大学，实际上就是民办大学。
三、学费不同
一本二本大学的学费大多数专业不会超过6000元，而独立学院学费一般在15000元左右。
四、毕业证、学位证颁发单位不同
毕业证和学位证是否相同是大家最关心的问题，其实早在2002年以前，独立学院毕业生的毕业证和学位证都是一样的，只是学费贵一点，相当于多花一点钱上大学，那时候上了独立学院的学生可是幸运多了。2002年后，独立学院学生毕业证开始由独立学院自己颁发，但学位证由所属大学颁发，2008年前后，独立学院的学位证也开始由独立学院自己颁发了，如下是主办大学和独立学院毕业证差别。
以贵州大学明德学院为例，本部大学校名为贵州大学，校长印章为本校校长，而其独立学院毕业证校名为明德学院，校长签章上为独立学院的院长。这下大家明白了吧，即使你读了一所名牌大学的独立学院，现在也拿不到主办大学的毕业证。
五、就业情况不一样
正因为毕业证颁发单位不一样，招聘单位一看颁发单位某某大学某某学院就知道是独立学院，是原来的三本，虽然是本科学历，考研等方面很多学校都制定本科为985、211大学，独立学院显然不在范畴。当然也有很多独立学院会因之改名，如青岛工学院之前为中国海洋大学青岛学院，改了名后就好多了，不过久很难吸引到考生的注意。