临床上根据肾盂肾炎的病情可分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎两种类型。
急性肾盂肾炎经积极彻底治疗，绝大多数可获根治，少数患者由于各种原因使感染持续，病程迁延，反复发作，也可发展为慢性肾盂肾炎，其是导致慢性肾衰竭的重要原因之一。
1、急性肾盂肾炎
多发生于生育年龄的女性，一般起病急骤，突然畏寒或寒战，随即发热，患者常主诉腰痛，肾区有压痛及叩击痛，多数患者表现为尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，并伴随有全身不适、头痛、恶心、呕吐等全身症状。
血常规检查白细胞总数升高，一般无高血压及氮质血症。
尿常规检查脓尿为其特征性改变，尿细菌培养及菌落计数是明显急性肾盂肾炎的重要指标。必须注意的是，不少急性肾盂肾炎的临床表现与膀胱炎很相似，有膀胱刺激症状而全身感染现象不明显，临床上有时很难与膀胱炎区别，常需借助实验室检查才能做出正确的诊断。
2、慢性肾盂肾炎
多数由急性肾盂肾炎未积极治疗或诱发因素（如泌尿道梗阻等）未能解除转变而来，亦有无明显的急性起病阶段者。慢性肾盂肾炎的症状轻微而且复杂，在漫长的肾盂肾炎病程中，患者常无明显的临床症状，其主要表现是真性细菌尿，尿中仅有少量白细胞和蛋白。
有时仅有疲乏感，不规则低热、腰酸、腰痛等。患者多有长期或反复发作的尿路感染病史，有时可出现急性尿路感染的症状。
在晚期可有贫血及血尿素氮升高，逐渐出现肾衰竭的现象，并可出现形体消瘦、神疲乏力、食欲缺乏等消化道症状，有些患者可有高血压。
由于慢性肾盂肾炎病变主要在肾髓质和乳头部，故肾小管的功能常先受累，肾浓缩功能障碍，所以有些患者出现多尿的症状，有的患者出现尿酸化功能失常而致继发肾小管酸性中毒，亦有的患者由于多尿性失钠或丢钾过多而演变为失钠性肾病或失钾性肾病。
有些无明显临床症状的慢性肾盂肾炎患者可以肾功能不全为其第一个临床表现。