云南农业大学和云南师范大学在云南省内影响力都比较大，也属于云南省内基础院校，实力都非常强。而且两所学校都获得了名校资源，云南农业大学是原云南大学的农学院独立建制的高校；而云南师范大学的基础来自西南联合大学的师范学院，都是老班底，实力都很强。
云南农业大学是1958年云南大学农学院独立成立的高校，早在1971年合并了云南农业劳动大学之后，就定名为云南农业大学，是一所老牌农业高校了。云南农业大学主要优势集中在畜牧、植物保护、作物、食品、农业资源方面。云南省气候和地理条件优越，植物多样性程度极高，因此对植物保护需求也特别浓，所以云南农业大学在植物保护方面实力较强。在植物保护方面早在1938年就开始教研，后来合并了云南农业大学之后，就单独设立了这个专业，建立了本、硕、博三层教研体系，实力确实比较突出。
云南农业大学第二块“招牌”就是畜牧学方面，这方面也是其建校之初就已经成立的专业，六十年代就单独设院了，而且形成了本科、硕士研究生、博士研究生、博士后科研流动站多个层次多维度的教研体系，是云南农业大学的“招牌”之一。云南省的气候对这方面的需求比较大，而且更有条件，只是在饲料方面欠缺，不过云南农业大学在育种、饲料、养殖等方面实力都比较强。
云南师范大学获得了西南联合大学师范学院的财产，不过后来大部分专业都分了出去，否则云南师范大学轻松晋级211工程大学，不过那都是“如果”，并非现实，但是云南师范大学基础文理基本得以保留，所以实力还是非常强的。整体来看，云南师范大学的综合实力略胜过云南农业大学一点，这主要得益于云南师范大学“创收”能力更强，相对受重视程度更高一些。